当被告人在刑事诉讼中被指控犯罪，且选择拒绝认罪认罚时，案件的审理流程会与认罪认罚的案件有所不同。以下将详细介绍这一过程，包括各个阶段的流程以及可能遇到的等待时间。
一、侦查阶段
侦查终结：在侦查阶段，公安机关会收集证据，如果被告人拒绝认罪认罚，侦查机关会对案件进行深入调查，直至侦查终结。
起诉意见书：侦查终结后，公安机关将制作起诉意见书，并将案件移送至人民检察院审查起诉。
二、审查起诉阶段
审查起诉：人民检察院收到案件后，将对案件进行审查，包括证据的合法性、充分性等。
起诉决定：审查完毕后，如果人民检察院认为被告人的行为构成犯罪，将决定起诉。
三、审判阶段
法院受理：人民检察院将起诉书连同案件材料一并移送给有管辖权的人民法院。
庭前准备：法院在开庭前，会进行一系列准备工作，包括但不限于排期、送达传票、确定辩护人等。
公开审理：庭审分为法庭调查、法庭辩论、被告人最后陈述等环节。如果被告人拒绝认罪认罚，庭审过程中可能需要更多的调查和质证。
四、案件审理流程详解
1. 法庭调查
- 审判长询问：审判长会询问被告人是否认罪认罚。
- 质证：控辩双方会对证据进行质证。
- 证人出庭：如有必要，证人将被传唤出庭作证。
2. 法庭辩论
- 控方发言：控方会陈述案件事实和适用法律，请求判决被告人有罪。
- 辩方辩论：辩方会陈述被告人无罪或罪轻的辩护理由。
3. 被告人最后陈述
- 被告人陈述：被告人有权利进行最后陈述。
五、等待时间
侦查阶段：时间长短不一，取决于案件的复杂程度和侦查工作的需要，通常在数月至一年内。
审查起诉阶段：通常在一个月以内。
审判阶段：根据案件复杂程度和法院的排期情况，从受理到宣判可能需要数周到数月不等。
六、特殊情况
- 案件复杂或争议大：审理时间可能会更长。
- 上诉或抗诉：如果被告人或检察院不服一审判决，提出上诉或抗诉，案件将进入二审程序，等待时间将进一步延长。
七、结语
拒绝认罪认罚后，案件审理流程较为复杂，等待时间也相对较长。然而，每个案件的具体情况都有所不同，因此审理时间和流程也可能会有所差异。在整个过程中，确保公平公正的审判是最重要的。